[83] Ribosome TI

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[83] Ribosome TI

Message par persalteas le Mar 6 Déc - 10:15

Salut bande de geeks.

Je vous présente mon dernier programme, qui convertit les séquences d'ADN en ARNmessager puis, tel un virtuose ribosome, vous donne la séquence peptidique qui sera traduite.

En gros, il fait le code génétique, mais avec un max d'options: Ok
________________________________________________________________________________

- Une présentation graphique inégalaaaable (avec "seulement" 3000 octets)

- Le choix de l'affichage des acides aminés en 1 lettre ou en 3 lettres.

- La possibilité de choisir la polarité de l'ADN, ou de partir d'un brin d'ARN directement.

- Il gère les codons-STOP.

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téléchargez donc ! [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien] Cool
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Ah oui, et pour ceux qui n'ont pas de cable, voilà le code du programme.
Je pense qu'il n'y a plus grand chose à dire question optimisation, mais on peut toujours regarder.

- Je rappelle que les lettres minuscules sont trouvables soit en faisant [2nde]+une touche soit dans le menu [vars][5] et en fouillant.

- LADN est la liste ADN, le premier L se trouvant dans le catalogue.

- [xhat] et [yhat] sont les x-barre et y-barre servant a représenter des moyennes d'habitude.

"code source":


BASIC Code a écrit::4→dim(∟ADN
:Lbl 0
:ClrHome
:FnOff :AxesOff:Split:ClrDraw
:Simul
:‾19→Xmin:2→Xmax:‾3→Ymin:3→Ymax
:If ∟ADN(1:Then
:¦ RecallPic 6
:¦ Else
:¦ DrawInv 2sin(X-π.5)-1
:¦ DrawInv 2cos(X)-1
:¦ DrawInv 2cos(X
:¦ DrawInv 2sin(X-π.5
:¦ Horizontal 3
:¦ Vertical ‾19
:¦ Vertical 2
:¦ Vertical ‾18
:¦ {‾17.8,2,‾17.4,2,‾17.8,.8,‾17.4,.8,‾17.8,‾2.2,‾17.4,‾2.2,‾1.8,‾2.8,.4,‾2.6,0,‾2.2,‾1,‾2.2,‾1.1,‾.8,.9,
¦ ‾.6,‾1.8,‾.4,1.3,.2,‾1.5,.4,.2,.8,‾1.1,2.2,.6,2.6,‾1.5,2.6,.2,3→L1
:¦ For(A,1,40,4
:¦ ¦ Line(L1(A),L1(A+1),L1(A+2),L1(A+3
:¦ End
:¦ StorePic 6
:¦ {1,1,0→∟ADN
:End
:Text(2,9,"ADN cOnverter
:Text(9,9,"(c)2011 Persa1teas
:Text(23,9,"Quitter
:1→C
:Repeat K=105
:¦ getKey→K
:¦ C+(K=34 and C<3)-(K=25 and C>1)→C
:¦ Line(‾18.5,2.1,‾17.4,2.1,(C=1
:¦ Line(‾18.5,.9,‾17.4,.9,(C=2
:¦ Line(‾18.5,‾2.1,‾17.4,‾2.1,(C=3
:End
:If C=3:Goto Z
:If C=2:Then
:¦ ClrDraw
:¦ RecallPic 6
:¦ Text(2,9,"par Persa1teas
:¦ Text(8,9,"reMercieMents a A1e[xhat]   
:¦ Text(14,9,"FerrarO.
:¦ Text(22,9,"Espace TI:FOruM
:¦ Pause
:End
:If C=1:Then
:¦ ClrDraw
:¦ RecallPic 6
:¦ Text(2,9,"entrer seQ (ADN)
:¦ Text(9,9,"entrer seQ (ARN)
:¦ Text(22,9,"OptiOns
:¦ 1→C
:¦ Repeat K=105
:¦ ¦ getKey→K
:¦ ¦ C+(K=34 and C<3)-(K=25 and C>1)→C
:¦ ¦ Line(‾18.5,2.1,‾17.4,2.1,(C=1
:¦ ¦ Line(‾18.5,.9,‾17.4,.9,(C=2
:¦ ¦ Line(‾18.5,‾2.1,‾17.4,‾2.1,(C=3
:¦ End
:¦ If C=3:Then
:¦ ¦ ClrDraw
:¦ ¦ RecallPic 6
:¦ ¦ Text(2,9,"NOMS:
:¦ ¦ Text(9,9,"POLARITE ADN-ARN:
:¦ ¦ 1→C
:¦ ¦ Lbl 8
:¦ ¦ If ∟ADN(2:Then
:¦ ¦ ¦ Text(2,30,"3 Lettre
:¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ Text(2,30,"1 Lettre     
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If ∟ADN(3:Then
:¦ ¦ ¦ Text(15,9,"NeGatiF     
:¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ Text(15,9,"POsiti
:¦ ¦ End
:¦ ¦ Text(22,9,"RETOUR
:¦ ¦ Repeat K=105
:¦ ¦ ¦ getKey→K
:¦ ¦ ¦ C+(K=34 and C<3)-(K=25 and C>1)→C
:¦ ¦ ¦ Line(‾18.5,2.1,‾17.4,2.1,(C=1
:¦ ¦ ¦ Line(‾18.5,.9,‾17.4,.9,(C=2
:¦ ¦ ¦ Line(‾18.5,‾2.1,‾17.4,‾2.1,(C=3
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If C=1:not(∟ADN(2→∟ADN(2
:¦ ¦ If C=2:not(∟ADN(3→∟ADN(3
:¦ ¦ If C=3:Goto 0
:¦ ¦ Goto 8
:¦ End
:¦ (C=1)→∟ADN(4
:¦ Input "SeQuence ?      ",Str0
:¦ 3iPart(length(Str0)/3
:¦ sub(Str0,1,Ans→Str0
:¦ ClrHome:ClrDraw:RecallPic 6
:¦ If ∟ADN(3) or ∟ADN(4:Disp "TranscriptiOn...
:¦ length(Str0→L
:¦ If ∟ADN(4)∟ADN(3:Then
:¦ ¦ " →Str7
:¦ ¦ Output(4,6,"/
:¦ ¦ Output(4,7,L
:¦ ¦ For(A,1,L
:¦ ¦ ¦ Output(4,2,A
:¦ ¦ ¦ sub(Str0,A,1→Str9
:¦ ¦ ¦ If Str9="T
:¦ ¦ ¦ "U→Str9
:¦ ¦ ¦ Str7+Str9→Str7
:¦ ¦ End
:¦ ¦ sub(Str7,2,L→Str0
:¦ End
:¦ If ∟ADN(4) xor ∟ADN(3:Then
:¦ ¦ " →Str7
:¦ ¦ Output(4,1,"     /
:¦ ¦ Output(4,7,L
:¦ ¦ For(A,1,L
:¦ ¦ ¦ Output(4,1,A
:¦ ¦ ¦ sub(Str0,A,1→Str9
:¦ ¦ ¦ If Str9="A":"U→Str8
:¦ ¦ ¦ If Str9="T" or Str9="U":"A→Str8
:¦ ¦ ¦ If Str9="C":"G→Str8
:¦ ¦ ¦ If Str9="G":"C→Str8
:¦ ¦ ¦ Str7+Str8→Str7
:¦ ¦ End
:¦ ¦ sub(Str7,2,L→Str0
:¦ End
:¦ ClrHome
:¦ Disp "Press [enter]...
:¦ Text(2,9,"ARNn       cOdant:
:¦ Text(2,23,"n
:¦ 1→A
:¦ Line(‾17.4,.8,‾3.6,.8
:¦ Line(‾18.1,‾2.2,‾3.6,‾2.2
:¦ Line(‾3.6,.8,‾3.6,‾2.2
:¦ Pt-On(‾17.8,.5
:¦ Pt-On(‾17.8,‾2
:¦ Pt-On(‾3.8,‾2
:¦ Pt-On(‾3.8,.5
:¦ Str0→Str9
:¦ Repeat 13:¦ ¦ Str9+" →Str9
:¦ End
:¦ Repeat K=105
:¦ ¦ getKey→K
:¦ ¦ Text(14,9,sub(Str9,A,14
:¦ ¦ A+(K=26 and A1→A
:¦ ¦ If A>1:Then
:¦ ¦ ¦ Text(13,5,"..
:¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ Text(13,5,"    
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If A:¦ ¦ ¦ Text(13,65,"..
:¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ Text(13,65,"   
:¦ ¦ End
:¦ ¦ Line(‾15.5,‾1.6,‾17.2,‾1.6,(A>1
:¦ ¦ Line(‾17,‾1.4,‾17,‾1.8,(A>1
:¦ ¦ Line(‾6.2,‾1.6,‾4.4,‾1.6,(A:¦ ¦ Line(‾4.7,‾1.4,‾4.7,‾1.8,(A:¦ End
:¦ ClrHome
:¦ Str9→Str0
:¦ "H2N-→Str1
:¦ ∟ADN(2→J
:¦ Output(4,6,"/"
:¦ Output(4,7,L
:¦ For(A,1,L,3
:¦ ¦ Output(4,2,A
:¦ ¦ sub(Str0,A,1→Str7
:¦ ¦ sub(Str0,A+1,1→Str8
:¦ ¦ sub(Str0,A+2,1→Str9
:¦ ¦ 0→K
:¦ ¦ If Str9="A" or Str9="G
:¦ ¦ 1→K
:¦ ¦ Str7+Str8→Str5
:¦ ¦ If Str5="AA
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ If K:Then
:¦ ¦ ¦ ¦ "K
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"L[yhat]s
:¦ ¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ ¦ "N
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"Asn
:¦ ¦ ¦ End:End
:¦ ¦ If Str5="CA
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ If K:Then
:¦ ¦ ¦ ¦ "Q
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"G1n
:¦ ¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ ¦ "H
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"His
:¦ ¦ ¦ End:End
:¦ ¦ If Str5="CG" or Str5="AG" and K:Then
:¦ ¦ ¦ "R
:¦ ¦ ¦ If J:"ArG
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="CU" or Str5="UU" and K:Then
:¦ ¦ ¦ "L
:¦ ¦ ¦ If J:"Leu
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="CC
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "P
:¦ ¦ ¦ If J:"PrO
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="GC
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "A
:¦ ¦ ¦ If J:"A1a
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="GA
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ If K:Then
:¦ ¦ ¦ ¦ "E
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"G1u
:¦ ¦ ¦ ¦ Else
:¦ ¦ ¦ ¦ "D
:¦ ¦ ¦ ¦ If J:"Asp
:¦ ¦ ¦ End:End
:¦ ¦ If Str5="GG
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "G
:¦ ¦ ¦ If J:"G1[yhat]
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="GU
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "V
:¦ ¦ ¦ If J:"Va1
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="UC" or Str5="AG" and not(K:Then
:¦ ¦ ¦ "S
:¦ ¦ ¦ If J:"Ser
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5+Str9="UGG
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "W
:¦ ¦ ¦ If J:"Trp
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="UG" and not(K:Then
:¦ ¦ ¦ "C
:¦ ¦ ¦ If J:"C[yhat]s
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="UU" and not(K
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "F
:¦ ¦ ¦ If J:"PHe
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="UA" and not(K:Then
:¦ ¦ ¦ "Y
:¦ ¦ ¦ If J:"T[yhat]r
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="UA" and K or Str5+Str9="UGA
:¦ ¦ "COOH   H2N
:¦ ¦ If Str5+Str9="AUG
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "M
:¦ ¦ ¦ If J:"Met
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="AU" and Str9≠"G
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "I
:¦ ¦ ¦ If J:"I1e
:¦ ¦ End
:¦ ¦ If Str5="AC
:¦ ¦ Then
:¦ ¦ ¦ "T
:¦ ¦ ¦ If J:"THr
:¦ ¦ End
:¦ ¦ Str1+Ans+"-→Str1
:¦ End:ClrHome
:¦ Str1+"COOH→Str1
:¦ Output(3,1,"<--          -->
:¦ Pause Str1
:End
:Goto 0
:Lbl Z
:DelVar L1DelVar Str9DelVar Str8DelVar Str7DelVar Str0DelVar Str5
:Full:ZStandard:AxesOn
:Output(1,1,"ADN cOnverter b[yhat]Persa1teas.
:Output(4,1,"Resu1tats sauvesdans Str1.


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Re: [83] Ribosome TI

Message par noelthebest le Mar 6 Déc - 12:12

Oh noooon ! J'en ai maaaare des transcriptions traductions ! T'as pas autre chose à faire ? Non

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Re: [83] Ribosome TI

Message par persalteas le Mar 6 Déc - 14:35

Ce processus gère la vie depuis qu'elle existe...

Sans lui tu ne serais pas en train de te plaindre :P

De plus, ce programme est fait pour t'éviter d'avoir à le faire toi même Clin Oeil

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Re: [83] Ribosome TI

Message par noelthebest le Mar 6 Déc - 17:51

Mouaiiiis...

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Re: [83] Ribosome TI

Message par Alexis le Mar 6 Déc - 20:15

Pas mal !

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Salut Invité, tu as posté 11 messages sur le forum.

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Re: [83] Ribosome TI

Message par persalteas le Mar 6 Déc - 22:35

rhalala il est rabat-joie le noelthebest...

Merci, Alexis !

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Re: [83] Ribosome TI

Message par linkakro le Mar 6 Déc - 22:56

Même appréciation que sur tout82 : je trouve la présentation de ton programme exceptionnelle et je suis curieux du code à l'intérieur. Très Content

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Re: [83] Ribosome TI

Message par persalteas le Mer 7 Déc - 9:00

pourquoi curieux ? Confus

je l'ai posté le code.

Tu veux que je t'explique un passage ???

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Re: [83] Ribosome TI

Message par linkakro le Mer 7 Déc - 11:26

Je veux dire que je m'y intéresse.
Ce que je ne comprends pas relève de notions de biologie et non de programmation. ^^
J'aime bien manipuler les chaînes alors j'ai l'intention de le potasser un de ces jours.

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Re: [83] Ribosome TI

Message par AlexRider38 le Mer 7 Déc - 12:10

wahou super prog persi

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Re: [83] Ribosome TI

Message par noelthebest le Mer 7 Déc - 12:31

Rabat-joie moi ? Il est bien ton prog', juste je suis allergique aux SVT depuis que je suis rentré en seconde (depuis longtemps donc ^^ ).

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Re: [83] Ribosome TI

Message par persalteas le Mer 7 Déc - 13:07

je ne suis pas un SVT :D

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Re: [83] Ribosome TI

Message par noelthebest le Mer 7 Déc - 13:18

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Re: [83] Ribosome TI

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